从外观上看，魅族PRO 6依然采用超窄边框设计，配备5.2英寸1080P分辨率触控屏，并采用了Super AMOLED面板，前面板边框0.715mm，2.5D水滴屏搭配正反两面R角让PRO 6 的机身拥有更好的一体成型。机身金属占比达到98％，背部采用大面积纳米注塑，两条天线开口解决了信号的问题。值得一提的是，PRO 6厚度为7.25mm，这也是魅族所有手机中最薄的一款。PRO 6同样支持快充技术，mCharge 3.0充电功率达到24W，比标准充电快2.4倍；此外，PRO 6使用USB 3.1 Type-C接口；网络制式上，采用双卡盲插的全网通设计，无缝接入中国三大移动运营商，支持 Cat.6标准，下载速度可达300Mbps，同时还支持VoLTE语音通信技术。交互模式上，搭载了3D-Press和mBack技术，可进一步提升用户的操作效率。

性能方面，它采用联发科Helio X25十核处理器，主频为2.0Ghz，GPU为Mail T880，拥有4GB RAM+64GB ROM的存储组合，并配备有500万像素前置镜头和2116万像素主摄像头。CMOS依然选择的是索尼IMX 230，支持相位对焦、0.07秒极速对焦等功能。5.2英寸的PRO 6内部主板面积相比PRO 5减少30%，使用来自Cirrus Logic的音频芯片，同时集成数字解码器和运放，优化后，HiFi音乐播放过程中功耗降低了55%。同时，PRO 6集成mSound技术，智能控制喇叭的振幅，提供更加出色的外放效果。系统方面，魅族PRO 6搭载基于Android 6.0的Flyme OS 5.2系统，支持3D-Press技术，并加入了一些贴心的功能。例如，高铁模式可以让手机在高铁环境下信号更加稳定，网络更加流畅；Soft SIM可以让用户使用较低的资费在国外上网；WiFi诊断工具可以帮助用户分析解决网络故障。