黑傑克，本名「間黑男」。從小父母離異，留下母親獨自照顧他。某日與母出遊，因為工程商的人為疏失，導致黑傑克誤踩未爆彈引起爆炸(在《怪醫黑傑克21》，秘密組織的BOSS「全滿德」已透露黑傑克小時候的意外是由他一手造成的，是他命令手下預先放下，透過意外，希望本間醫生應用他組織的高強技術在黑傑克身上。)母親送醫後不治，他也受重傷瀕臨死亡。幸虧本間丈太郎醫師的高明醫術救活了他。當下，他立下了兩個志願：成為像本間醫師一樣的外科醫師與報復殺死母親的工程商…… 動畫版中他在一次謀殺未遂事件中發現父母離異是另有隱情，21年前那場事故並不是意外，是一個企圖取他性命的神秘組織所為，這一切絕對是和父親身邊的人事物有著關係。 就在此時，黑傑克在恩師本間醫師的醫院裡發現了一張相片，不知為了什麼原因，本間醫師與父親一起在相片裡，解開謎團的關鍵就在這張相片，為了揭穿這個巨大的陰謀，黑傑克與皮諾可展開冒險之旅……