核战争结束二十年后，人类几近灭亡，世界化为一片废墟。楼房倾塌，森林被烧为灰烬，遍布辐射尘的地表被各种变异生物占据。最后的幸存者们蜷缩在莫斯科地铁站与隧道中，建立起新的团体、城镇和文明，在挣扎求生的同时，也开始了无休无止的斗争与厮杀。人类沦为野兽，最后的避难所变为永久的牢笼。

年轻的阿尔乔姆生活在地铁北部的展览馆站，他始终无法忘记已经离去的母亲，也热衷于幻想战前世界的模样。随着神秘生物“黑暗族”的威胁日益加剧，为挽救家园，阿尔乔姆接受了向其他站台求援的重任。他踏上了穿越整个地铁网的旅途，而人类的最终命运也渐渐从黑暗中浮现……