富士GFX 50s机身材质为镁铝合金，并且支持全天候保护，搭配G卡口标准定焦镜头（GF63mm F2.8 R WR）整机重约1230g（单机身825g），这要比传统的中画幅轻便许多。GFX 50s外观复古，体积大小与普通全画幅产品相差不大，但GFX 50s要更厚一些。机身顶部有ISO与快门转盘，并且快门转盘右侧有配备1.28英寸的肩屏，方便快速更改与查看参数设定，背部的设计则与目前的X-Pro2类似，依旧拥有8向焦点选择拨杆，方便快捷。

同时GFX 50s的EVF可拆卸，并且可以根据需求更换翻折式EVF，其角度可以更改为最大角度90°，竖拍时范围更改为±45°。自带EVF规格为0.5英寸369万点，拥有0.85倍放大倍率。GFX 50s背面显示屏采用3.2英寸236万点屏幕，并且支持触摸屏操作，可选择菜单和自动对焦点、放大和缩小图像等操作。为了方便低角度取景，与X-T2一样，GFX 50s具有三向倾斜LCD屏幕，可向上向下与向左翻折。

FUJIFILM GFX 50s搭载5140万像素（单个像素尺寸为5.3um），43.8×32.9mm的中画幅CMOS，并搭载XProcessor Pro图像处理引擎，与目前旗舰X-Pro2、X-T2相同。除了传统的胶片模拟之外，GFX 50s还增加了一个全新的“色彩效果”功能，官方表示“色彩效果”功能是为色彩高度饱和物体进行特别优化呈现效果（提供更高的灰度，以方便后期）。GFX 50s机身配备焦平面快门，机械快门最高1/4000s（寿命为15万次），电子快门最高1/16000s，闪光同步速度为1/125s，ISO范围是100～12800。