该故事发生在明治维新初年的东京。主人公绯村剑心在幕末是维新派的刽子手，人称“拔刀斋”，杀人无数。在新时代，他使用一柄逆刃刀四处流浪，立志不再杀人。在东京的神谷道场，剑心遇到了阿薰及一帮朋友们。他是否找到了呢——剑的方向，心的归属。

逆刃之剑，也许是想就这样悄悄的藏住自己的锋芒的，可是剑终归是剑，能够出鞘的剑就更没有理由来说自己已经把自己隐藏得很好。

也许是想避开那些权利的争斗，也许是想避开无谓的纷扰，可是拔刀斋始终是属于那个一开始就被叫做拔刀斋的人，就算有人能够继承，就算别人能够抢去这样的名号，但是人们提起这个名字，脑海里还是一个火红的背影。