第三部（13至28卷）的主人公是空条承太郎和他的替身使者朋友们。为了救被替身影响的母亲荷莉，他们要在90天内找到邪恶主使DIO，并将其打败。于是，承太郎与外公乔瑟夫，以及几位也拥有替身能力的好友，一同踏上了旅程。这一路当然不太平，DIO派出的使者多次阻挠，双方展开多场精彩战斗。最终JOJO能否救回母亲，这同行的伙伴又能否顺利回来呢？

JOJO系列漫画中非常重要的设定——“替身”，在这部首次出现，之后这一设定延续整个系列。许多深受大家喜爱的角色都出自这一设定。