《奇妙自然小百科》这套书分为《怎么办》《真好听》《去哪儿呀》《谁的家》《好美味》5册。

《怎么办》讲述了自然界会医术的一些神奇的动物。分别有：小鸡、大狗、鹦鹉、猴子、大象、野兔、河马、野雉鸡。它们治病的方法五花八门，形式各样，充分展现了在自然界强大的生存本领和智慧的求生之道。

《真好听》讲述了自然界能发出奇特声音的各种动物。分别有：老鼠、猫、麻雀、猪、青蛙、母鸡、马、蜜蜂。它们有着自然界赋予的特殊声音，并用这些声音表达着各自的生存需求。

《去哪儿呀》讲述了自然界经常进行大迁移的动物。分别有：斑马、藏羚羊、野骆驼、帝企鹅、帝王蝶、大雁、火烈鸟、绿海龟。它们或是翻山越岭，或是横穿沙漠，或是飞越大江大河。在这些迁徙中寻求适合自己的生存环境。

《谁的家》讲述了自然界会建筑的一些神奇的动物。分别有：园丁鸟、鹦鹉螺、白蚁、缝叶莺、石蛾、红灶巢鸟、土拨鼠。它们本领各异，建造的房子式样繁多，有的甚至令人叹为观止。

《好美味》讲述了自然界善于制造和发现美食的神奇动物。分别有：日本猕猴、花栗鼠、切叶蚁、北极狐、秃鹫、红松鼠、蜜蜂。它们在有限的生存条件下，聪明地利用太阳、海水、冰雪等外力来让食物变得更美味。